Uaxactún est une cité plus petite située à quelques kilomètres/miles au nord de Tikal (voir carte). Son organisation et son architecture sont semblables à  Tikal avec la particularité que l'on y trouve une des plus anciennes pyramides mayas (Temple E-VII-Sub) datée de la période Préclassique. La plate-forme de cette pyramide a des trous de poteaux suggérant que les premiers temples étaient faits en matières végétales comme les huttes. D'après sa position sur le site, cette pyramide était probablement un observatoire pour repérer  des événements astronomiques en relation avec le calendrier.

Uaxactún fut conquise en 378 ap. J.-C. lorsque Tikal devint la cité dominante du Petén. Le souverain Grande Patte de Jaguar de Tikal conquit la cité en établissant une nouvelle tradition guerrière chez les Mayas: la conquête territoriale. Dès lors, la guerre ne se faisait plus seulement pour obtenir des victimes de sacrifice mais aussi pour contrôler d'autres royaumes.